重点实验室包括甘肃省环境地质与灾害防治工程技术研究中心（地质灾害和地下水监测实验中心）、原国土资源部野外科学观测研究基地（地质灾害--甘肃省兰州野外基地和黄土崩滑--甘肃永靖野外基地）、甘肃省地下水工程及地热资源重点实验室、甘肃省联合培养研究生示范基地（环境地质与灾害防治）、祁连山研究中心、省地矿局矿山地质环境恢复与治理中心六个实验科研机构。我院产学研结合迈出了坚实的步伐，队伍建设成果不断显现。